1. Frumugreining og próteinafvæðing
Á upphafsstigi plasmíðs DNA útdráttar þarf að greina frumur til að losa DNAið inni. Þetta ferli er venjulega náð með því að nota háan styrk af söltum, þvottaefnum eða ensímum. Í þessu ferli er aðalhlutverk Tris að viðhalda sýrustigi lausnarinnar stöðugu og vernda þannig DNA frá súru umhverfi sem myndast við leysingarferlið. Að auki getur Tris einnig hjálpað til við að einangra DNA úr lýsum með því að bindast og afneðra prótein.
2. DNA leysni og stöðugleika
Eftir frumugreiningu þarf að greina plasmíð DNA og einangra það frá öðrum frumuþáttum. Þetta ferli er venjulega náð með því að nota háan styrk af salti eða þvottaefni. Í þessu ferli er aðalhlutverk Tris að veita viðeigandi jónastyrk og pH umhverfi til að stuðla að leysni og stöðugleika DNA. Hýdroxýl- og amínóhópar Tris geta myndað vetnis- og jónatengi við DNA sameindir, sem koma á stöðugleika í uppbyggingu þess og koma í veg fyrir niðurbrot þess. Að auki getur Tris verndað DNA enn frekar gegn niðurbroti með því að hindra virkni kjarnasa.
3. DNA hreinsun og endurheimt
Eftir að plasmíð DNA er einangrað úr lýsinu þarf oft röð af hreinsunarskrefum til að fjarlægja leifar af próteinum, RNA og öðrum óhreinindum. Þessi skref fela í sér fenól/klóróform útdrátt, útfellingu etanóls o.s.frv. Í þessu ferli er aðalhlutverk Tris að halda pH-gildi lausnarinnar stöðugu og vernda þannig DNA frá súru eða basísku umhverfi sem getur myndast við hreinsun. Að auki getur Tris einnig hjálpað til við að endurheimta hreint plasmíð DNA úr lausn með því að bindast óhreinindum og leyfa þeim að falla út.
