Tris buffer er almennt notaður pH buffer sem er mikið notaður í lífefnafræðilegum tilraunum. Í PCR viðbrögðum hamlar Tris buffer DNase virkni auk þess að viðhalda pH stöðugleika. Verkunarháttur þess kemur aðallega fram í eftirfarandi þáttum:
1. Breyta virku sniði DNasa: Katjónin í Tris biðminni getur bundist virka stað DNase, breytt lögun þess og þar með dregið úr virkni þess. Þessi verkunarmáti hindrar virkni núkleasa sem eru til staðar í umhverfinu og verndar DNA sniðmátið gegn niðurbroti.
2. Samkeppnishömlun: Katjónirnar í Tris geta tengst DNA sniðmátinu í samkeppni við virka miðju DNasa og þar með komið í veg fyrir bindingu DNasa við sniðmátið og dregið úr niðurbrotsvirkni þess. Þessi samkeppnishömlun getur dregið úr DNase virkni af völdum óhreininda í hvarfkerfinu.
3. Auka hvarfhitastig: Tris buffer hefur góðan stöðugleika við háan hita, þannig að það getur aukið hitastig PCR hvarfsins. Hár hiti getur hindrað virkni DNase enn frekar og bætt mögnunarvirkni DNA pólýmerasa. Með því að sameina hátt hitastig með Tris buffer er hægt að útrýma áhrifum DNase og fá hreinni PCR vöru.
